Informations générales
La réunion annuelle 2013 de l'ANR Biotempo se déroulera à Paris les 10 et 11 avril, dans l'Antenne Parisienne de l'INRIA, 23 avenue de l'Italie, 2 deux pas de la place d'Italie, dans le 14ème arrondissement. Le 10 au soir, un restaurant a été reservé: Chez Clement, 106 Bd du Montparnasse Metro Vavin.
Programme des journées (prévisionnel)
10 avril
- TGF-beta: modèles hybrides
- 10h00-10h40: Geoffroy Andrieux, A guarded transition approach to integrate the human cell signaling pathways into a single unified dynamic model.
- 10h40-11h20: Loïc Paulevé, Abstract interpretation of dynamics of very large networks: overview and future work.
- TGF-beta: modèles "rules-based"
- 11h40-12h20: François Fages, Analyse du modèle TGF-b en biocham-web.
- 12h20-13h00: Jérôme Feret, Context-sentitive approximation of the intrinsic flow of information for rule-based models.
- TGF-beta: modèles quantitatifs; réduction abstraction
- 14h30-15h10: Ovidiu Radulescu, A tropical approach to multiscale model reduction of TGF-b signaling.
- 15h10-15h50: Vincent Picard, Algorithmes de Gillespie exact et approché d'ordre supérieur pour la simulation de réseaux biochimiques.
- Oursins: modèles quantitatifs
- 16h10-16h50: Jérémie Bourdon, Modèle probabiliste de la traduction de cyclines lors de la fécondation de l'oursin.
- 16h50-17h30: Patrick Cormier et Adrien Richard, Modèle quantitatif de la régulation de la traduction lors de la fécondation de l'oursin.
11 avril
- Benchmarking: reconstruction de modèles
- 9h30-10h10: Sylvain Prigent, Reconstruction automatique du réseau métabolique d'Ectocarpus Siliculosus.
- 10h10-10h50: Santiago Videla, Boolean logic models of signal transduction networks.
- Bactéries: identification de régulateurs
- 11h20-12h00: Andres Aravena, A logics-based integrative approach to decipher putative regulatory relationships inferred from genomic and transcriptomic data.
- 12h00-12h20: Damien Eveillard, Integrating heterogeneous knowledge within a static framework: toward biological insights.
- 12h20-12h40: Sven Thiele, Solving the computational questions of D. Eveillard.
- Développements
- 14h00-14h40: Sylvain Soliman, Tropical Equilibration by Constraint Solving PDF.
- 14h40-15h10: Michel Le Borgne, Les moteurs de CADBIOM.
- Développements et diffusion
- 15h40-16h20: Julien Gras, the BIOtempo Mobyle portal.
- 16h20-17h: Bilan et discussions
Liste des participants
- Geoffroy Andrieux
- Andres Aravena
- Michel Le Borgne
- Jeremie Bourdon
- Guillaume Collet
- Patrick Cormier
- Damien Eveillard
- Francois Fages
- Jérôme Feret
- Julien Gras
- Alejandro Maass
- Thierry Martinez
- Loïc Paulevé
- Vincent Picard
- Sylvain Prigent
- Ovidiu Radulescu
- Adrien Richard
- Francesco Santini
- Anne Siegel
- Sylvain Soliman
- Nathalie Theret
- Sven Thiele
- Santiago Videla
